海报上的标语为「暴かれたダブルフェイス！宿命が导く、顶上决戦ミステリー!!」（暂译：曝光的双面人！命运引导的顶尖对决）。这是在说柯南和小哀的身份终于要被揭穿了吗？还是说黑衣人组织里面还潜藏着另外的卧底呢？
故事大纲：
在一个漆黑的夜晚，日本警方被一名间谍侵入。多国情报机构，如英国的MI6、德国的BDN、美国的CIA和FBI的机密文件遭窃。由安室透率领导的公安及时赶到，与间谍展开了追逐。在追逐中，间谍驾驶的汽车被FBI特工赤井秀一来复枪子弹击中，从公路上翻落。
第二天，柯南和他的朋友去一家新近重建的水族馆游玩。在水族馆的大摩天轮下，柯南发现了一个容貌靓丽的女性。这个人孤零零的呆着，还受了伤，而且她有一对异色瞳的眼睛。
不过，这个女人现在处在失忆状态，她甚至记不起来自己的姓名，而她携带的手机也已经坏了不能用。柯南和他的朋友答应帮助她找回记忆，因此他们就陪她在一起。
以上种种都被在背后监视的苦艾酒看在眼里。之后，她拔出消声器，并在内部通信器中说到“就是这样，琴酒。”
